隋朝统一全国后，结束了西晋以来三百余年的分裂局面，相继平息了突厥、吐谷浑等反隋势力，收复了河西。隋改鸣沙县为敦煌县，并于大业初年（605－609年）遣尚书左丞裴矩视察敦煌，了解丝绸之路及中西通商贸易情况，在敦煌举办了有西域各国商贾参加的商贸交流会，并遣将西驻，移民实边，开垦农田，敦煌出现了空前的繁荣和安定，敦煌石窟艺术风格为之一变，开始走向极盛期。

唐灭隋后，于619年收复河西，在敦煌置沙州，敦煌县属沙州管辖。武德五年（622年）在河西设凉、甘、瓜、肃、沙五州，但地方反唐势力仍雄强一时。贞观十四年（640年），唐太宗李世民一举铲除了东西大道上以西突厥为主的障碍，确保了丝路的畅通，敦煌达到了历史上最辉煌的时期。玄宗开元十五年（727年），河西拉开了唐蕃战幕，瓜州城一度为吐蕃攻陷。“安史之乱”后，唐调河西兵力东去平叛，吐蕃乘虚进犯河西。沙州虽驻劲旅，但经不住吐蕃重兵长达十年的围困，终于箭尽粮绝，寡不敌众，于781年开城降蕃。吐蕃统治敦煌67年，经济文化一度繁荣，莫高窟中出现了灿烂的吐蕃佛教艺术。

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