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    海岛地区最大的生物差异。该地区也被认为是古巴探测最少的自然区域,那里仍然有许多从没做过任何收集的特定区域。亚历杭德罗·德·洪堡公园包含古巴记载的28种植物群系中的16种陆地植物,包括低海拔的、山下的、山区的雨林,雾林,旱生型的多刺的灌木丛,松树林,半落叶林,河边林,红树林。公园有不完全植物林名单,包括1,302种种子植物,145种蕨类植物,其中有405种古巴地方特有的,几乎占了古巴地方特有物种报告的30%。在整个数据中,343种只适合在该地区生存。当地的植物物种中包括5种食虫植物,其中一种是唯一生长在古巴的附生植物。也有两种地方特有的罗汉松属和龙血树属物种。 

      公园内拥有古巴国内最丰富的动物群,拥有10种哺乳动物、95种鸟类、45种爬行动物、21种两栖动物和191种昆虫。至少有30%的哺乳动物、21%的鸟类、83.3%的爬行动物、95.8%的两栖动物,以及27.7%的昆虫是当地或古巴特有的。该地区对于几个物种是尤其重要的,是特殊保护关系。尤其认为已经灭绝的一种啄木鸟、存活数量已经少到不足12的地方特有物种古巴鸢和古巴沟齿鼠。地区的森林是古巴绿色小鹦鹉和古巴长尾小鹦鹉,以及居住和迁徙鸟类的重要栖息地,至于爬行动物,最近在该公园发现了三种新的蜥蜴类动物,以及仅在该公园一些特殊区域才能发现的世界上最小的青蛙。在公园的海域内,有大群的加勒比海

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