作为吴真人本源之地的厦门,信奉保生大帝的自然非常之多。据清道光间《厦门志》所载,厦门单独奉祀保生大帝的庙宇虽然只有吴厝巷寿山宫、桥仔头玄妙宫、马柱青龙宫、后莲鳌山宫4座,但同时奉祀天后和吴真人的宫府却达23座之多。考虑到清廷对妈祖的大力推崇,估计有一些宫庙,原本是只奉祀保生大帝,后来在官方的鼓吹下,才一道供奉妈祖。如西门外的慈济宫,也是同时奉祀吴真人和妈祖的。但从宫名可以看出,原先必是保生大帝庙,妈祖当是后来才摆进去的。

     对保生大帝的信仰,在台湾民间同样非常流行。这大约同开台初期,瘴疠多,得病后缺医少药,

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