原住民信仰的神灵，有创造宇宙的主神、自然神、精灵妖怪等几种。创造宇宙主神是宇宙的创造者和主宰人类吉凶祸福之神，如布农人的“利加宁”，曹人的“哈冒”，都是创造宇宙的最高主神。自然神是以广大自然物和自然现象为对象之神，如日月、星辰、山川、风云、雷电等，被认为具有伟大力量，可主宰人类祸福安危。原住民又常把自然神与司理神混淆合一，如认为山神就是狩猎神，河神就是渔泽之神等。司理神是掌管某一事务的神，阿美人、卑南人信这种神，已有人格化和系统化的倾向。司理神也有善恶之分，如山神、水神、风神、雨神、谷神、猎神、家宅之神等为善神；疫神、瘴神等为恶神。精灵崇拜是万物有灵的具体表现，原住民的精灵观念，大都属于泛神崇拜，又称精灵崇拜，即认为宇宙之中，到处都充满精灵。精灵的产生是由于恐惧，尤其是死亡，因为原始的生活环境充满了危险，部族中很多人都不能随自然凋谢而走完人生的旅程。

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